《砥柱铭》从南宋到清代，一直在民间流传，历经众多著名藏家之手，未曾进入宫廷内府，故一直没有官方著录。其先是被南宋第一鉴赏家王厚之收藏，王厚之曾在长卷上“烙”下了十六字骑缝印七处(第五缝被切)，外加卷尾一完整版及另一印。大约在1250年至1260年左右，又被南宋重要大藏家、权相贾似道收藏，长卷末尾钤有贾似道著名的朱文收藏印“秋壑图书”。元朝天顺元年(1328)，《砥柱铭卷》为黄庭坚八世孙黄璂所得，此后至明隆庆庚午(1570)，中间240余年，一直由黄氏家族保存。大约就在黄氏之后，《砥柱铭卷》为明代大收藏家项元汴收藏，项元汴曾在卷前卷后及骑缝处钤印六十余方。清朝前期，此卷初归项源小天籁阁，后辗转被嘉兴吴修所藏。经过清代各藏家收藏后，《砥柱铭》流入广东藏家之手，并与广东藏家有过近百年的因缘，张维屏、罗天池、潘仕成均收藏过此卷。道光二十九年(1843)，潘仕成将此卷并山谷两通墓志铭稿一齐刻入《海山仙馆藏真续刻》(见第二、三卷)，这也是《砥柱铭卷》唯一收入刻帖的历史，今广东博物馆尚存有部分拓片。20世纪上半叶，《砥柱铭》从广东经由上海流往日本，被日本著名收藏家藤井齐成有邻馆收藏。2000年，在台湾寒舍艺术中心王定乾的帮助下，《砥柱铭》流到台湾藏家手中。2010年又经王定乾牵线，台湾藏家将《砥柱铭》送拍至北京保利，被一神秘中国买家电话竞拍获得。