由于二战的爆发，佩吉设法将自己的藏品转移到美国，并在1942年创建了名为“这个世纪的艺术”（“Art of this Century”）的私人博物馆，向公众及艺术家们开放。尽管这座博物馆办得有声有色，但佩吉还是决定在战后定居威尼斯。之所以这样做，既是为自己的藏品，也是在为自己寻找最后的归宿。早在与作家劳伦斯·威尔（Laurence Vail）的蜜月旅行期间，佩吉就得以结识伯爵夫人路易莎·卡萨地（Luisa Casati），她是一位米兰工业家的女儿。有意思的是，几十年之后，正是路易莎将自己在威尼斯未完成的莱昂尼威尼斯宫（the Palazzo Venier dei Leoni）卖给了佩吉，成为其私人宅邸，并在那里展示自己的收藏。虽然在将藏品永久性地迁移到意大利这件事上遇到了重重困难（主要是高昂的运输费用）与阻挠，但是，通过1948年“威尼斯双年展”这个良机，佩吉坚定了定居威尼斯的决心。

　　从佩吉·古根海姆的收藏经历来看，她涉入这个领域带有很大的偶然性，很明显，她的收藏范围界定在当时不为主流品位所容许的“现代艺术”。除了牟利的动机之外，她的收藏活动在某种意义上是对当时传统的背叛，为了自己的兴趣而进行收藏，而且这种收藏特色一直贯穿其一生。在她生命最后的威尼斯时期，佩吉支持一些年轻的意大利先锋派艺术家并收藏他们的作品。自1976年以来，威尼斯的佩吉·古根海姆收藏馆已然成为古根海姆基金会的一个不可或缺的部分。佩吉·古根海姆于此年把她的博物馆及其藏品给了纽约的古根海姆基金会。如今，在大运河上的莱昂尼威尼斯宫已经成为该地最受尊崇和观赏最多的人文景观之一。佩吉·古根海姆对于她的叔叔所忽视的超现实主义、美国抽象表现主义画派的支持，最终形成了威尼斯古根海姆博物馆艺术藏品的特色，这正是纽约总部所匮乏的。当两者合并成为一个整体之时，这两部分藏品则组成了一个复杂而具有多种价值的西方现代艺术史。